遷延性咳嗽は3週間以上8週間未満、慢性咳嗽は8週間以上持続する咳のこと。
咳嗽は、痰を伴わない、または伴ってもごく少量の「乾性咳嗽（乾いた咳）」と、痰を出すために生じる「湿性咳嗽（湿った咳）」の2種類に分類できる。
乾性咳嗽は「コンコン」「コホコホ」などといった咳、湿性咳嗽は「ゴホンゴホン」「ゼイゼイ」「ゲボゲボ」といった咳のことだ。
3週間未満の急性咳嗽の原因の多くは感染症だが、期間が長くになるにつれ感染症の頻度は下がり、慢性咳嗽になると感染症以外の頻度が増える。
遷延性咳嗽・慢性咳嗽の原因としては大きく2つ、感染症と感染症以外に分けられる。
感染症としてはマイコプラズマ肺炎、百日咳、肺結核、非結核性抗酸菌症、副鼻腔気管支症候群といったものが中心になる。
感染症以外の原因としてはアレルギー性疾患（気管支喘息・咳喘息やアトピー咳嗽、後鼻漏など）、胃食道逆流症、感染後咳嗽、薬物による咳嗽、現喫煙者における慢性気管支炎、COPD、その他（肺がん、間質性肺炎等）があげられる。
「気管支喘息」は気道の粘膜が慢性的にアレルギー炎症を起こしているために、気道の内腔が狭くなり、ちょっとした刺激でもすぐに咳や痰、呼吸困難になったり「ゼイゼイ」「ヒューヒュー」といった喘鳴などの症状が現れたりする。
また「咳喘息」は喘鳴や呼吸困難はなく慢性的に乾性咳嗽だけが続く病気で気管支喘息の前段階だと考えられている。
「アトピー咳嗽」もアレルギー性の咳嗽であり、「後鼻漏」は過剰に分泌された鼻水が喉の方へ流れ落ちてくる症状のことで、咳が出たり痰がからんだりする。
「胃食道逆流症」は胃液が食道に逆流し、胸焼けやゲップ、胸の痛みなどが生じる病気で胃液が食道の入り口あたりまで逆流すると、のどが炎症を起こして咳が続くことがある。
「感染後咳嗽」は風邪や気管支炎など、気道が炎症を起こしたあとに長引く咳のこと。
また「薬剤による咳嗽」では、高血圧の人が飲む「降圧剤」の中には副作用で咳が出るものがある。
そのほか、肺がんや間質性肺炎といった疾患でも咳嗽が続くことがある。

下記の検査を行い、疾患の鑑別をする。

① 視診／咽頭など症状があるときに確認する
② 聴診／聴診器で心音・呼吸音を聞く
③ 画像検査／「胸部レントゲン写真」や
「胸部CT写真」等の検査、肺に病変があるか、あれば病変の性状などを確認するために行う
④ スパイロメーター／肺機能検査を測定する。気管支喘息やCOPDなどの疾患は、気道が細くなり閉塞性換気障害といわれるものを起こす
⑤ 呼気NO濃度検査／気道のアレルギー性炎症の評価
⑥ 血液検査／アレルギー検査や感染症がないか調べる
⑦ 喀痰検査／感染症を起こす菌を調べたり、肺がんなどにおけるがん細胞をチェックしたりする場合に行う
⑧ その他／気管支鏡検査など

遷延性咳嗽・慢性咳嗽は原因によってそれぞれ治療法が異なるので、原因を見極めたうえで、それに適した治療を行わなければいけない。
基本的には乾性咳嗽では、咳を抑え、湿性咳嗽は痰の量を減らして痰を外に出やすくすることを目標にする。
感染症と診断された場合は、その原因微生物に応じた抗生剤を用いて治療する。
感染症以外の疾患と診断された場合はその疾患に応じた薬物を用いる。
遷延性咳嗽や慢性咳嗽では重篤な疾患が隠れていることがあるため、早目に受診し、必要なら治療を受けることをすすめる。

① 気管支喘息・咳喘息／吸入ステロイド薬や気管支拡張薬が中心となる
② アトピー咳嗽、後鼻漏／アレルギー薬などを用いる
③ 胃食道逆流症／逆流性食道炎の治療として、酸を抑える胃薬等を用いる
④ 感染後咳嗽／通常は自然軽快することが多いが、遷延する場合は鎮咳薬等で治療する。アレルギー薬や漢方薬などを用いる場合もある
⑤ 現喫煙者における慢性気管支炎・COPD／気管支拡張薬を使う。必要に応じて抗生剤を用いる。基本は禁煙となる
⑥ その他（肺がん、間質性肺炎等）／診断後疾患に応じた治療になる