「患者さんの診察室への入室時から診察は始まる」と考える院長は、まず視診で患者の様子を観察。
顔色や姿勢、歩き方などで状態を判断する。
肥満や腰の曲がりがあると、腹部が圧迫されて胃の中の圧力が高くなるため、胃液の逆流が起こりやすくなり、逆流性食道炎の原因となる可能性もある。
初診では年齢や性別も考慮しながら、「どんなときに症状が出るか」「ほかにどんな症状があるか」「喫煙や飲酒の習慣はどうか」「ピロリ菌を指摘されたことがあるか」などを詳しく問診。
視診や触診と合わせて疾患の可能性を探る。
ピロリ菌感染がある（陽性）と、萎縮性胃炎や胃・十二指腸潰瘍、胃がんの可能性があるため内視鏡検査を勧める。
食道や胃の疾患の可能性が疑われたり、検査経験がない場合も検査を勧め、症状の原因となる疾患の有無などを調べる。

検査は前夜21時以降は絶食して翌朝来院してもらい、次の6つの流れで行う。

① 胃の中の泡を取る消泡剤を服用。
② 喉に麻酔剤をスプレーする。
③ 観察しやすいよう胃の動きを止める薬剤を注射。緑内障や前立腺肥大、
心臓疾患、糖尿病の人には使えない薬剤があるため、問診で十分確認しておく。希望者には鎮静剤の投与も行う。
④ 検査台に横になり、基本的に経口で内視鏡を挿入し、検査を開始。使用するのは径約6㎜の細径内視鏡で、経鼻内視鏡と同じ細さ。一般的な径8～9㎜の経口内視鏡より飲み込みやすく、楽に検査できる。内視鏡の先端部には、臓器の状態をカラー映像で捉える超小型高性能カメラや、体内を照らすライトガイド、レンズが汚れたときに水や空気を噴出して洗い流すノズル、粘液の吸引や組織採取・処置に使う処置具を出す鉗子口などが埋め込まれている。ライトの光源は通常光と病変を目立たせる特殊光の2種類で、必要に応じて切り替える。
⑤ まずは通常光でモニター画面に画像を映し出し、食道、十二指腸、胃の順に観察。見落としがないよう注意を払い、同時に撮影も行う。
⑥ 内視鏡を抜く際、食道では特殊光に切り替えて病変の有無を確認する。

胃の背景粘膜から潰瘍やがんのリスクが推察可能なため、まず胃粘膜の萎縮の有無を確認する。
萎縮があれば、その程度も見極める。
ピロリ菌が陰性なら粘膜はきれい（萎縮は認めない）だが、陽性では粘膜の萎縮を認めて潰瘍もできやすく、萎縮が進行するとがんのリスクも高まる。
そのため、より注意深く観察を行う。
潰瘍があれば組織を採取して検査（生検／患者の体の一部を切り取って、顕微鏡で詳しく調べること）し、がんの有無を確認。
早期がんが疑われる場合は、表面の凹凸が明瞭になるよう色素を散布して病変や深達度を診断し、生検する。
ポリープがあれば良性か悪性かも見極める。
萎縮のない胃にできるポリープは良性のことが多く、がん化することは少ないので不必要な生検はしない。
正常粘膜が盛り上がっているように見える粘膜下腫瘍は、腫瘍が正常粘膜に覆われ、生検しても確定診断できないため経過観察とする。
しかし、不安を感じる患者や腫瘍径が2㎝を超えたり増大傾向にあるものは、超音波内視鏡を含めた精密検査ができる病院を紹介する。
食道の観察時は「びらん（表面のただれ）や色調の変化はないか」「胃の入り口（噴門）が緩くなり、胃酸が逆流する可能性はないか」も観察。
特に食道がんは予後不良で、通常の内視鏡観察では早期がんを発見することが難しいため、病変を認識しやすくする特殊光を用いている。
このように、院長は経験に裏打ちされた高い診断能力で、早期がんを多く発見している。

検査で逆流性食道炎と診断すれば、胃酸を抑える薬剤などを処方する。胃粘膜に萎縮が見られれば、ピロリ菌感染の可能性が高いため検査を行い、陽性なら除菌治療を行う。 抗生物質2類と胃酸を抑える薬1種類を1週間服用し、2か月後に尿素呼気テストで除菌判定をする。 しかし、除菌が成功しても胃がんになるリスクはゼロにはならないため、定期的な内視鏡検査を勧める。
生検の結果、早期がんが確定すれば、内視鏡的治療ができる連携病院を紹介。
治療後は患者を再び受け入れ、がん治療連携パスに準じて、内視鏡検査を含めた定期的な経過観察を実施。 有害事象発生時は速やかに連携病院の担当医に連絡を行う。